Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAMD11Q96NU1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAMD11Q96NU1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAMD11Q96NU1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms