Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms