Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VCPIP1Q96JH7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms