Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHDQ96IW2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHDQ96IW2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms