Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ZNF496Q96IT1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF496Q96IT1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF496Q96IT1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF496Q96IT1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF496Q96IT1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF496Q96IT1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF496Q96IT1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF496Q96IT1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF496Q96IT1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF496Q96IT1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF496Q96IT1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF496Q96IT1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF496Q96IT1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF496Q96IT1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF496Q96IT1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF496Q96IT1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF496Q96IT1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF496Q96IT1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms