Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRRFQ96E11 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRRFQ96E11 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRRFQ96E11 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms