Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
VTI1AQ96AJ9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms