Protein–RNA interactions for Protein: Q92963

RIT1, GTP-binding protein Rit1, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT1Q92963 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RIT1Q92963 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIT1Q92963 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIT1Q92963 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIT1Q92963 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIT1Q92963 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIT1Q92963 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIT1Q92963 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIT1Q92963 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIT1Q92963 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RIT1Q92963 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RIT1Q92963 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIT1Q92963 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIT1Q92963 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIT1Q92963 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RIT1Q92963 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIT1Q92963 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RIT1Q92963 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIT1Q92963 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIT1Q92963 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIT1Q92963 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIT1Q92963 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIT1Q92963 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIT1Q92963 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIT1Q92963 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIT1Q92963 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RIT1Q92963 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIT1Q92963 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIT1Q92963 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RIT1Q92963 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIT1Q92963 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIT1Q92963 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT1Q92963 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT1Q92963 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT1Q92963 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT1Q92963 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT1Q92963 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT1Q92963 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT1Q92963 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT1Q92963 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT1Q92963 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms