Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE22Q8NFJ8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE22Q8NFJ8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE22Q8NFJ8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE22Q8NFJ8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE22Q8NFJ8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BHLHE22Q8NFJ8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BHLHE22Q8NFJ8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE22Q8NFJ8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms