Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVV2

LOXHD1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXHD1Q8IVV2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LOXHD1Q8IVV2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LOXHD1Q8IVV2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LOXHD1Q8IVV2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LOXHD1Q8IVV2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LOXHD1Q8IVV2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LOXHD1Q8IVV2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LOXHD1Q8IVV2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LOXHD1Q8IVV2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LOXHD1Q8IVV2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LOXHD1Q8IVV2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LOXHD1Q8IVV2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms