Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX29P2Q8IUI4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms