Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG4DQ86TL0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms