Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8BQ6P9F7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8BQ6P9F7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8BQ6P9F7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8BQ6P9F7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8BQ6P9F7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8BQ6P9F7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8BQ6P9F7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8BQ6P9F7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC8BQ6P9F7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRRC8BQ6P9F7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC8BQ6P9F7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms