Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT4

SLC30A6, Zinc transporter 6, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC30A6Q6NXT4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC30A6Q6NXT4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC30A6Q6NXT4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC30A6Q6NXT4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC30A6Q6NXT4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC30A6Q6NXT4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC30A6Q6NXT4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC30A6Q6NXT4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms