Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT80Q6KB66 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT80Q6KB66 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms