Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDLRAD1Q5T700 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LDLRAD1Q5T700 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms