Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BRDTQ58F21 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRDTQ58F21 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRDTQ58F21 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BRDTQ58F21 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRDTQ58F21 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
BRDTQ58F21 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRDTQ58F21 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms