Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A12Q504Y0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A12Q504Y0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms