Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KHDC1Q4VXA5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms