Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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