Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIK5Q16478 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
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