Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHHQ15465 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHHQ15465 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHHQ15465 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHHQ15465 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHHQ15465 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHHQ15465 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHHQ15465 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHHQ15465 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHHQ15465 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHHQ15465 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHHQ15465 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHHQ15465 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHHQ15465 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHHQ15465 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SHHQ15465 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SHHQ15465 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHHQ15465 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHHQ15465 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHHQ15465 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHHQ15465 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHHQ15465 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHHQ15465 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHHQ15465 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHHQ15465 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHHQ15465 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHHQ15465 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHHQ15465 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHHQ15465 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHHQ15465 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHHQ15465 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHHQ15465 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHHQ15465 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHHQ15465 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHHQ15465 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHHQ15465 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SHHQ15465 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHHQ15465 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHHQ15465 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHHQ15465 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHHQ15465 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHHQ15465 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHHQ15465 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHHQ15465 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHHQ15465 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHHQ15465 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHHQ15465 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHHQ15465 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHHQ15465 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHHQ15465 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHHQ15465 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SHHQ15465 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHHQ15465 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHHQ15465 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHHQ15465 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHHQ15465 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHHQ15465 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHHQ15465 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHHQ15465 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SHHQ15465 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHHQ15465 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHHQ15465 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHHQ15465 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHHQ15465 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHHQ15465 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHHQ15465 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHHQ15465 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHHQ15465 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SHHQ15465 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHHQ15465 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SHHQ15465 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHHQ15465 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHHQ15465 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHHQ15465 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHHQ15465 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHHQ15465 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHHQ15465 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHHQ15465 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHHQ15465 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHHQ15465 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SHHQ15465 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHHQ15465 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SHHQ15465 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHHQ15465 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHHQ15465 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHHQ15465 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHHQ15465 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHHQ15465 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHHQ15465 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SHHQ15465 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHHQ15465 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHHQ15465 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHHQ15465 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHHQ15465 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHHQ15465 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHHQ15465 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHHQ15465 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHHQ15465 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SHHQ15465 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHHQ15465 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
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