Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC1AQ14683 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SMC1AQ14683 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC1AQ14683 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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