Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH17Q12864 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH17Q12864 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms