Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPTFQ12830 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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