Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 ECT1YGR007W 972 nt4.96□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 HPM1YIL110W 1134 nt4.96□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 YBL029WYBL029W 1131 nt4.96□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 ATM1YMR301C 2073 nt4.96□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 STE7YDL159W 1548 nt4.96□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 BUD7YOR299W 2241 nt4.96□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 FZO1YBR179C 2568 nt4.96□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 UBX7YBR273C 1311 nt4.96□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 GCN20YFR009W 2259 nt4.95□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 TDA7YNL176C 1911 nt4.95□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt4.95□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.95□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 YAR061WYAR061W 204 nt4.95□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 YOR289WYOR289W 756 nt4.95□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 YOR342CYOR342C 960 nt4.95□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 ARR1YPR199C 885 nt4.95□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 IFM1YOL023W 2031 nt4.95□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 SPO77YLR341W 1434 nt4.95□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 YOR1YGR281W 4434 nt4.95□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 GLT1YDL171C 6438 nt4.95□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 RRP3YHR065C 1506 nt4.94□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 LAS21YJL062W 2493 nt4.94□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 CLF1YLR117C 2064 nt4.94□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt4.94□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 YGR153WYGR153W 654 nt4.94□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 YHR214WYHR214W 612 nt4.94□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 YAR066WYAR066W 612 nt4.94□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 YIF1YNL263C 945 nt4.94□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 RMI1YPL024W 726 nt4.94□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 PUT1YLR142W 1431 nt4.94□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 RKM4YDR257C 1485 nt4.94□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 MSC7YHR039C 1935 nt4.93□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 DHH1YDL160C 1521 nt4.93□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 PRM1YNL279W 1986 nt4.93□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 TPS3YMR261C 3165 nt4.93□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 INO2YDR123C 915 nt4.93□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 YKL169CYKL169C 384 nt4.93□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 YPR109WYPR109W 885 nt4.93□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.93□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.93□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 PMT5YDL093W 2232 nt4.92□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 CAF4YKR036C 1932 nt4.92□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 GRE3YHR104W 984 nt4.92□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 NTR2YKR022C 969 nt4.92□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 UIP3YAR027W 708 nt4.92□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 ROT1YMR200W 771 nt4.92□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 GRE1YPL223C 507 nt4.92□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 PCL10YGL134W 1302 nt4.92□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 ALG2YGL065C 1512 nt4.92□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 YGR125WYGR125W 3111 nt4.91□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 CNL1YDR357C 369 nt4.91□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 HSP31YDR533C 714 nt4.91□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 YLF2YHL014C 1218 nt4.91□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 GAT3YLR013W 426 nt4.91□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 NCE103YNL036W 666 nt4.91□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 NRG2YBR066C 663 nt4.91□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 GDB1YPR184W 4611 nt4.91□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 TOS3YGL179C 1683 nt4.91□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 SWI3YJL176C 2478 nt4.91□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 TIP20YGL145W 2106 nt4.9□□□□□ -1.62
VPS54Q12071 YDL183CYDL183C 963 nt4.9□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 SCS2YER120W 735 nt4.9□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YGL262WYGL262W 528 nt4.9□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 SPC34YKR037C 888 nt4.9□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.9□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 ATG14YBR128C 1035 nt4.9□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 TFG1YGR186W 2208 nt4.9□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 SET4YJL105W 1683 nt4.89□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 OMS1YDR316W 1416 nt4.89□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 MAL13YGR288W 1422 nt4.89□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 BLM10YFL007W 6432 nt4.89□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 MKS1YNL076W 1755 nt4.89□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YBR139WYBR139W 1527 nt4.89□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 MMS2YGL087C 414 nt4.89□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt4.89□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YJL220WYJL220W 453 nt4.89□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 DSE3YOR264W 1293 nt4.89□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 IMD3YLR432W 1572 nt4.89□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 PRO2YOR323C 1371 nt4.89□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 PRP43YGL120C 2304 nt4.89□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 FAA3YIL009W 2085 nt4.88□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 RAD30YDR419W 1899 nt4.88□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 HIR2YOR038C 2628 nt4.88□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 GAL4YPL248C 2646 nt4.88□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YDR445CYDR445C 408 nt4.88□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 NPY1YGL067W 1155 nt4.88□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YJL215CYJL215C 360 nt4.88□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 NMA1YLR328W 1206 nt4.88□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 SLZ1YNL196C 897 nt4.88□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 HXT7YDR342C 1713 nt4.88□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 HXT6YDR343C 1713 nt4.88□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 STP4YDL048C 1473 nt4.88□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 KAR2YJL034W 2049 nt4.87□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 ASK10YGR097W 3441 nt4.87□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 PRM7YDL039C 2097 nt4.87□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 SUP35YDR172W 2058 nt4.87□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 FRE1YLR214W 2061 nt4.87□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YEL067CYEL067C 588 nt4.87□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YER147C-AYER147C-A 411 nt4.87□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 RPP0YLR340W 939 nt4.87□□□□□ -1.63
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