Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 SPO77YLR341W 1434 nt5.31□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 RNR3YIL066C 2610 nt5.3□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 GAS3YMR215W 1575 nt5.3□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YGR011WYGR011W 327 nt5.3□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt5.3□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 CIA2YHR122W 696 nt5.3□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 MRP21YBL090W 534 nt5.3□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 ECM23YPL021W 564 nt5.3□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 EIS1YMR031C 2532 nt5.3□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 MSC2YDR205W 2175 nt5.29□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 CLA4YNL298W 2529 nt5.29□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 RKM4YDR257C 1485 nt5.29□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 CPR4YCR069W 957 nt5.29□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 HNT2YDR305C 654 nt5.29□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.29□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 MDY2YOL111C 639 nt5.29□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YPL071CYPL071C 471 nt5.29□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 ERG4YGL012W 1422 nt5.29□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 DNF2YDR093W 4839 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 GSH2YOL049W 1476 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 VAN1YML115C 1608 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YER190C-BYER190C-B 483 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YFL068WYFL068W 483 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 MMS2YGL087C 414 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 SPO74YGL170C 1242 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 UBI4YLL039C 1146 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YML133W-BYML133W-B 483 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 CKA2YOR061W 1020 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 DSE3YOR264W 1293 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 MRP51YPL118W 1035 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 TSL1YML100W 3297 nt5.28□□□□□ -1.56
RIM20Q12033 TUP1YCR084C 2142 nt5.27□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 YER134CYER134C 537 nt5.27□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 YER147C-AYER147C-A 411 nt5.27□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt5.27□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 TUL1YKL034W 2277 nt5.27□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 SIS2YKR072C 1689 nt5.27□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 PDR15YDR406W 4590 nt5.27□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 ATG1YGL180W 2694 nt5.27□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 YHR182WYHR182W 2358 nt5.27□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 UBP7YIL156W 3216 nt5.27□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 SAF1YBR280C 1914 nt5.27□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 DXO1YDR370C 1329 nt5.26□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 PGM2YMR105C 1710 nt5.26□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 YBL029WYBL029W 1131 nt5.26□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 SPO19YPL130W 672 nt5.26□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 IXR1YKL032C 1794 nt5.26□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 CAB3YKL088W 1716 nt5.26□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 ALD3YMR169C 1521 nt5.25□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 ALD2YMR170C 1521 nt5.25□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 URA3YEL021W 804 nt5.25□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 YKR104WYKR104W 921 nt5.25□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 GAT3YLR013W 426 nt5.25□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 YGP1YNL160W 1065 nt5.25□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 SPS18YNL204C 903 nt5.25□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 URE2YNL229C 1065 nt5.25□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 SMP1YBR182C 1359 nt5.25□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 DBF2YGR092W 1719 nt5.25□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 BOP2YLR267W 1713 nt5.25□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 MET3YJR010W 1536 nt5.24□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 YER158CYER158C 1722 nt5.24□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 YEL045CYEL045C 426 nt5.24□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 SPR6YER115C 576 nt5.24□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 LSO1YJR005C-A 282 nt5.24□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 BUD17YNR027W 954 nt5.24□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 YOR342CYOR342C 960 nt5.24□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 PMA1YGL008C 2757 nt5.24□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 SWC3YAL011W 1878 nt5.24□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 PCL10YGL134W 1302 nt5.23□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 TFC7YOR110W 1308 nt5.23□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 MEC3YLR288C 1425 nt5.23□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 FLC3YGL139W 2409 nt5.23□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 NAT2YGR147C 867 nt5.23□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 ECM1YAL059W 639 nt5.23□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 YOR289WYOR289W 756 nt5.23□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 ARR1YPR199C 885 nt5.23□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 DHH1YDL160C 1521 nt5.23□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 RIP1YEL024W 648 nt5.22□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.22□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 YHR214WYHR214W 612 nt5.22□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 YIL028WYIL028W 399 nt5.22□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 YKR075CYKR075C 924 nt5.22□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 PAU17YLL025W 375 nt5.22□□□□□ -1.57
RIM20Q12033 YAR066WYAR066W 612 nt5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.6 ms