Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK18Q07002 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms