Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBE1Q04446 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms