Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLCB3Q01970 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLCB3Q01970 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms