Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC10Q01780 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms