Protein–RNA interactions for Protein: Q01581

HMGCS1, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1Q01581 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMGCS1Q01581 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGCS1Q01581 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGCS1Q01581 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms