Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVK-24P63145 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVK-24P63145 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVK-24P63145 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVK-24P63145 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVK-24P63145 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVK-24P63145 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVK-24P63145 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVK-24P63145 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVK-24P63145 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms