Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AFDNP55196 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
AFDNP55196 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AFDNP55196 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AFDNP55196 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AFDNP55196 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AFDNP55196 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AFDNP55196 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AFDNP55196 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
AFDNP55196 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AFDNP55196 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AFDNP55196 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AFDNP55196 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AFDNP55196 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AFDNP55196 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AFDNP55196 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AFDNP55196 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AFDNP55196 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AFDNP55196 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
AFDNP55196 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AFDNP55196 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AFDNP55196 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AFDNP55196 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AFDNP55196 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AFDNP55196 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
AFDNP55196 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AFDNP55196 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
AFDNP55196 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AFDNP55196 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AFDNP55196 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
AFDNP55196 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AFDNP55196 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AFDNP55196 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
AFDNP55196 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AFDNP55196 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AFDNP55196 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AFDNP55196 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AFDNP55196 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AFDNP55196 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AFDNP55196 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AFDNP55196 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AFDNP55196 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AFDNP55196 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AFDNP55196 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AFDNP55196 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AFDNP55196 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AFDNP55196 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AFDNP55196 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
AFDNP55196 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AFDNP55196 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AFDNP55196 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
AFDNP55196 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
AFDNP55196 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AFDNP55196 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AFDNP55196 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
AFDNP55196 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AFDNP55196 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AFDNP55196 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AFDNP55196 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AFDNP55196 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AFDNP55196 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AFDNP55196 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AFDNP55196 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AFDNP55196 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
AFDNP55196 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
AFDNP55196 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AFDNP55196 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AFDNP55196 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AFDNP55196 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AFDNP55196 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AFDNP55196 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AFDNP55196 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
AFDNP55196 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AFDNP55196 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
AFDNP55196 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AFDNP55196 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AFDNP55196 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AFDNP55196 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AFDNP55196 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AFDNP55196 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AFDNP55196 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AFDNP55196 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AFDNP55196 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AFDNP55196 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AFDNP55196 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AFDNP55196 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AFDNP55196 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AFDNP55196 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AFDNP55196 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AFDNP55196 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AFDNP55196 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AFDNP55196 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AFDNP55196 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AFDNP55196 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AFDNP55196 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AFDNP55196 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AFDNP55196 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AFDNP55196 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AFDNP55196 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AFDNP55196 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms