Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMP1P54849 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMP1P54849 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMP1P54849 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMP1P54849 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EMP1P54849 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMP1P54849 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMP1P54849 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMP1P54849 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMP1P54849 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMP1P54849 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMP1P54849 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMP1P54849 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMP1P54849 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMP1P54849 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMP1P54849 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMP1P54849 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMP1P54849 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMP1P54849 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EMP1P54849 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMP1P54849 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMP1P54849 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMP1P54849 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMP1P54849 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMP1P54849 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMP1P54849 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMP1P54849 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMP1P54849 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMP1P54849 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMP1P54849 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMP1P54849 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMP1P54849 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMP1P54849 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMP1P54849 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMP1P54849 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMP1P54849 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMP1P54849 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMP1P54849 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMP1P54849 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMP1P54849 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMP1P54849 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMP1P54849 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMP1P54849 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMP1P54849 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMP1P54849 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMP1P54849 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMP1P54849 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMP1P54849 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMP1P54849 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMP1P54849 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMP1P54849 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMP1P54849 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMP1P54849 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMP1P54849 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMP1P54849 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EMP1P54849 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EMP1P54849 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMP1P54849 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMP1P54849 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMP1P54849 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMP1P54849 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EMP1P54849 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMP1P54849 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMP1P54849 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMP1P54849 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMP1P54849 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMP1P54849 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMP1P54849 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMP1P54849 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMP1P54849 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMP1P54849 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMP1P54849 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EMP1P54849 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EMP1P54849 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMP1P54849 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMP1P54849 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMP1P54849 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMP1P54849 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMP1P54849 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMP1P54849 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMP1P54849 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMP1P54849 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMP1P54849 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMP1P54849 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMP1P54849 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMP1P54849 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMP1P54849 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMP1P54849 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMP1P54849 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMP1P54849 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMP1P54849 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMP1P54849 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMP1P54849 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EMP1P54849 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMP1P54849 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMP1P54849 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMP1P54849 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMP1P54849 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EMP1P54849 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMP1P54849 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms