Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATN1P54259 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATN1P54259 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATN1P54259 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATN1P54259 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATN1P54259 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATN1P54259 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATN1P54259 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATN1P54259 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATN1P54259 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATN1P54259 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATN1P54259 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATN1P54259 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATN1P54259 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATN1P54259 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATN1P54259 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATN1P54259 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATN1P54259 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATN1P54259 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATN1P54259 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATN1P54259 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATN1P54259 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATN1P54259 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATN1P54259 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATN1P54259 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATN1P54259 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATN1P54259 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATN1P54259 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATN1P54259 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATN1P54259 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATN1P54259 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATN1P54259 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATN1P54259 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATN1P54259 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATN1P54259 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATN1P54259 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATN1P54259 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATN1P54259 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATN1P54259 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATN1P54259 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATN1P54259 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATN1P54259 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATN1P54259 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATN1P54259 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATN1P54259 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATN1P54259 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATN1P54259 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATN1P54259 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATN1P54259 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATN1P54259 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATN1P54259 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATN1P54259 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATN1P54259 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATN1P54259 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATN1P54259 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATN1P54259 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATN1P54259 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATN1P54259 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATN1P54259 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATN1P54259 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATN1P54259 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATN1P54259 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATN1P54259 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATN1P54259 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATN1P54259 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATN1P54259 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATN1P54259 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATN1P54259 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATN1P54259 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATN1P54259 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATN1P54259 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATN1P54259 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATN1P54259 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATN1P54259 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATN1P54259 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATN1P54259 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATN1P54259 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATN1P54259 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATN1P54259 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATN1P54259 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATN1P54259 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATN1P54259 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATN1P54259 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATN1P54259 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATN1P54259 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATN1P54259 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATN1P54259 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATN1P54259 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATN1P54259 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATN1P54259 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATN1P54259 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATN1P54259 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATN1P54259 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATN1P54259 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATN1P54259 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATN1P54259 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATN1P54259 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATN1P54259 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATN1P54259 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATN1P54259 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms