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Protein–RNA interactions for Protein: P52918
MSN5, Protein MSN5, yeast
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1,224 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
MSN5
P52918
tR(ACG)O
tR(ACG)O
73 nt
6.95
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
YJR157W
YJR157W
363 nt
6.95
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
PER33
YLR064W
822 nt
6.95
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
ATP14
YLR295C
375 nt
6.95
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
YIM2
YMR151W
438 nt
6.95
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
CSI2
YOL007C
1026 nt
6.95
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
YBR230W-A
YBR230W-A
201 nt
6.95
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
RTT106
YNL206C
1368 nt
6.95
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
UTR2
YEL040W
1404 nt
6.94
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
XBP1
YIL101C
1944 nt
6.94
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
ATP16
YDL004W
483 nt
6.94
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
CRD1
YDL142C
852 nt
6.94
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
PRO3
YER023W
861 nt
6.94
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
HSP12
YFL014W
330 nt
6.94
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
RPT6
YGL048C
1218 nt
6.94
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
YHR070C-A
YHR070C-A
411 nt
6.94
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
BCY1
YIL033C
1251 nt
6.94
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
YIL089W
YIL089W
618 nt
6.94
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
HEK2
YBL032W
1146 nt
6.94
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
DUG3
YNL191W
1074 nt
6.94
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
YOL118C
YOL118C
309 nt
6.94
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
YDR261W-A
YDR261W-A
1317 nt
6.94
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
CUS1
YMR240C
1311 nt
6.94
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
ECM38
YLR299W
1983 nt
6.93
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
SLO1
YER180C-A
258 nt
6.93
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
MOB2
YFL034C-B
864 nt
6.93
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
UPF3
YGR072W
1164 nt
6.93
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
BAT2
YJR148W
1131 nt
6.93
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
NSE1
YLR007W
1011 nt
6.93
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
REC102
YLR329W
795 nt
6.93
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
MAC1
YMR021C
1254 nt
6.93
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
RCL1
YOL010W
1104 nt
6.93
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
PSH1
YOL054W
1221 nt
6.93
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
GAL7
YBR018C
1101 nt
6.93
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
RRP7
YCL031C
894 nt
6.93
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
OPT1
YJL212C
2400 nt
6.93
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
GFA1
YKL104C
2154 nt
6.93
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
ORC5
YNL261W
1440 nt
6.93
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
HOS1
YPR068C
1413 nt
6.93
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
SLX5
YDL013W
1860 nt
6.92
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
snR83
snR83
306 nt
6.92
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
CWC21
YDR482C
408 nt
6.92
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
COX2
Q0250
756 nt
6.92
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
AIM19
YIL087C
474 nt
6.92
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
RFA3
YJL173C
369 nt
6.92
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
COX5A
YNL052W
462 nt
6.92
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
MDY2
YOL111C
639 nt
6.92
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
YPL261C
YPL261C
309 nt
6.92
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
SAM4
YPL273W
978 nt
6.92
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
RSA4
YCR072C
1548 nt
6.91
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
KTR7
YIL085C
1554 nt
6.91
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
YCR097W-A
YCR097W-A
267 nt
6.91
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
DSD1
YGL196W
1287 nt
6.91
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
YGL262W
YGL262W
528 nt
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□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
PPX1
YHR201C
1194 nt
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□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
YIL047C-A
YIL047C-A
369 nt
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□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
TEF4
YKL081W
1239 nt
6.91
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
ICT1
YLR099C
1185 nt
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□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
LTO1
YNL260C
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MSN5
P52918
YOL159C-A
YOL159C-A
273 nt
6.91
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
YOR318C
YOR318C
306 nt
6.91
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
ATG14
YBR128C
1035 nt
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MSN5
P52918
YNL011C
YNL011C
1335 nt
6.91
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MSN5
P52918
HMS1
YOR032C
1305 nt
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□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
SUP19
tS(UGA)E
82 nt
6.9
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
SUP17
tS(UGA)I
82 nt
6.9
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
SUP16
tS(UGA)P
82 nt
6.9
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
CKA1
YIL035C
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6.9
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
TTI2
YJR136C
1266 nt
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□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
MIC27
YNL100W
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6.9
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
GLO4
YOR040W
858 nt
6.9
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
YBR071W
YBR071W
636 nt
6.9
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
COM2
YER130C
1332 nt
6.9
□□□□□ -1.3
MSN5
P52918
AMD1
YML035C
2433 nt
6.9
□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
STB3
YDR169C
1542 nt
6.9
□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
BI3
Q0115
1554 nt
6.9
□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
FPR2
YDR519W
408 nt
6.89
□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
CAB1
YDR531W
1104 nt
6.89
□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
EFG1
YGR271C-A
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6.89
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MSN5
P52918
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YHR043C
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6.89
□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
DOG1
YHR044C
741 nt
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□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
YKR070W
YKR070W
1059 nt
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□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
YLR326W
YLR326W
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□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
ECM15
YBL001C
315 nt
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□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
ECM13
YBL043W
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□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
YNR062C
YNR062C
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MSN5
P52918
TRM10
YOL093W
882 nt
6.89
□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
PFK27
YOL136C
1194 nt
6.89
□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
FIG1
YBR040W
897 nt
6.89
□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
ARP3
YJR065C
1350 nt
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□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
COQ6
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1440 nt
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□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
MRS2
YOR334W
1413 nt
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□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
GUD1
YDL238C
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□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
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YJL105W
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□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
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YML114C
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MSN5
P52918
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YCR069W
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6.88
□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
INO2
YDR123C
915 nt
6.88
□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
SPR28
YDR218C
1272 nt
6.88
□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
DDI2
YFL061W
678 nt
6.88
□□□□□ -1.31
MSN5
P52918
RPS31
YLR167W
459 nt
6.88
□□□□□ -1.31
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