Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GTF2A2P52657 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2A2P52657 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms