Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC41.42■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.4■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC41.37■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
SMARCA4P51532 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC41.3■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
SMARCA4P51532 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC41.26■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
SMARCA4P51532 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms