Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt5.02□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 LDB18YLL049W 540 nt5.02□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 YAR061WYAR061W 204 nt5.02□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 YNL143CYNL143C 393 nt5.02□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 SSO1YPL232W 873 nt5.02□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 NGL2YMR285C 1548 nt5.02□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 SET4YJL105W 1683 nt5.02□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 STE20YHL007C 2820 nt5.01□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 TFC7YOR110W 1308 nt5.01□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 MED2YDL005C 1296 nt5.01□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 RMR1YGL250W 726 nt5.01□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 REX3YLR107W 1215 nt5.01□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.01□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 NOC4YPR144C 1659 nt5.01□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 DOA1YKL213C 2148 nt5□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 YAP1802YGR241C 1707 nt5□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 PGM2YMR105C 1710 nt5□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 COT1YOR316C 1320 nt5□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 ADE6YGR061C 4077 nt5□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 SDA1YGR245C 2304 nt5□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 ERV14YGL054C 417 nt5□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 UIP3YAR027W 708 nt5□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 FKH1YIL131C 1455 nt5□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 YTA6YPL074W 2265 nt4.99□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 KAR2YJL034W 2049 nt4.99□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 MCM4YPR019W 2802 nt4.99□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 GRX4YER174C 735 nt4.99□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 NVJ1YHR195W 966 nt4.99□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 MAP2YBL091C 1266 nt4.99□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 DNF2YDR093W 4839 nt4.99□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 FRS1YLR060W 1788 nt4.99□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 MAL13YGR288W 1422 nt4.98□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 AFT1YGL071W 2073 nt4.98□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 RRP3YHR065C 1506 nt4.98□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 MET3YJR010W 1536 nt4.98□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 PFA5YDR459C 1125 nt4.98□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 GLE2YER107C 1098 nt4.98□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 YFR035CYFR035C 345 nt4.98□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 YJR085CYJR085C 318 nt4.98□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 YOL050CYOL050C 321 nt4.98□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 NDJ1YOL104C 1059 nt4.98□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 YPL199CYPL199C 723 nt4.98□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 RVB1YDR190C 1392 nt4.98□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 IXR1YKL032C 1794 nt4.98□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 VID30YGL227W 2877 nt4.98□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 DRN1YGR093W 1524 nt4.97□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 SKG3YLR187W 3081 nt4.97□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 YEL074WYEL074W 339 nt4.97□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 YGL185CYGL185C 1140 nt4.97□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 TEF4YKL081W 1239 nt4.97□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 PEX22YAL055W 543 nt4.97□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 YKR104WYKR104W 921 nt4.97□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 CSR1YLR380W 1227 nt4.97□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 GSP2YOR185C 663 nt4.97□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 MAK3YPR051W 531 nt4.97□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 HSP26YBR072W 645 nt4.97□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 GMC1YDR506C 1827 nt4.97□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 OMS1YDR316W 1416 nt4.97□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 PAF1YBR279W 1338 nt4.97□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 CBP1YJL209W 1965 nt4.96□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 PEX29YDR479C 1665 nt4.96□□□□□ -1.61
YBL055CP34220 PCL8YPL219W 1479 nt4.96□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 SMP1YBR182C 1359 nt4.96□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 NPY1YGL067W 1155 nt4.96□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 YIL086CYIL086C 309 nt4.96□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 YLR124WYLR124W 345 nt4.96□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 COG5YNL051W 1212 nt4.96□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 RAD17YOR368W 1206 nt4.96□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 POS5YPL188W 1245 nt4.96□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 ISA2YPR067W 558 nt4.96□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 CKS1YBR135W 453 nt4.96□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 SUP35YDR172W 2058 nt4.96□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 MCM21YDR318W 1107 nt4.95□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 GRE3YHR104W 984 nt4.95□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 YIL028WYIL028W 399 nt4.95□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 MPS3YJL019W 2049 nt4.95□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 SIF2YBR103W 1608 nt4.94□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 ARO2YGL148W 1131 nt4.94□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 SUT1YGL162W 900 nt4.94□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.94□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.94□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 YPL073CYPL073C 486 nt4.94□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 PUT1YLR142W 1431 nt4.94□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 TFG1YGR186W 2208 nt4.93□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 BUD7YOR299W 2241 nt4.93□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 SNF3YDL194W 2655 nt4.93□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 YEL045CYEL045C 426 nt4.93□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 YGR122WYGR122W 1209 nt4.93□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 YHR214WYHR214W 612 nt4.93□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.93□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 SKG1YKR100C 1068 nt4.93□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 YAR066WYAR066W 612 nt4.93□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 SMA1YPL027W 738 nt4.93□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.93□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.93□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 ASK10YGR097W 3441 nt4.93□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 APL6YGR261C 2430 nt4.93□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 RAD30YDR419W 1899 nt4.92□□□□□ -1.62
YBL055CP34220 MOB2YFL034C-B 864 nt4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms