Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCD1P33897 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCD1P33897 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms