Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms