Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFRSF8P28908 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF8P28908 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms