Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRMP28827 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PTPRMP28827 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRMP28827 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRMP28827 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRMP28827 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRMP28827 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRMP28827 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRMP28827 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRMP28827 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRMP28827 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRMP28827 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRMP28827 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRMP28827 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRMP28827 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRMP28827 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PTPRMP28827 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRMP28827 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRMP28827 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRMP28827 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRMP28827 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PTPRMP28827 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
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