Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMLP26374 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMLP26374 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMLP26374 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMLP26374 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMLP26374 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMLP26374 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMLP26374 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMLP26374 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMLP26374 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMLP26374 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHMLP26374 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHMLP26374 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHMLP26374 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHMLP26374 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHMLP26374 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHMLP26374 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CHMLP26374 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHMLP26374 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHMLP26374 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHMLP26374 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHMLP26374 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHMLP26374 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHMLP26374 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHMLP26374 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHMLP26374 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHMLP26374 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHMLP26374 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHMLP26374 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHMLP26374 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMLP26374 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMLP26374 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMLP26374 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMLP26374 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMLP26374 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMLP26374 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMLP26374 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMLP26374 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMLP26374 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMLP26374 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMLP26374 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMLP26374 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMLP26374 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMLP26374 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMLP26374 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMLP26374 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMLP26374 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMLP26374 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMLP26374 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMLP26374 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMLP26374 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMLP26374 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMLP26374 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMLP26374 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMLP26374 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMLP26374 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMLP26374 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMLP26374 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHMLP26374 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMLP26374 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMLP26374 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMLP26374 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMLP26374 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMLP26374 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMLP26374 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMLP26374 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMLP26374 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMLP26374 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMLP26374 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMLP26374 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMLP26374 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMLP26374 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMLP26374 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMLP26374 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMLP26374 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMLP26374 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMLP26374 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMLP26374 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHMLP26374 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHMLP26374 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHMLP26374 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHMLP26374 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHMLP26374 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHMLP26374 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHMLP26374 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHMLP26374 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CHMLP26374 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHMLP26374 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHMLP26374 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHMLP26374 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHMLP26374 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMLP26374 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMLP26374 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMLP26374 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMLP26374 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMLP26374 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMLP26374 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMLP26374 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMLP26374 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMLP26374 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms