Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2AP24928 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2AP24928 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
POLR2AP24928 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms