Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCP2P22307 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCP2P22307 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCP2P22307 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCP2P22307 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCP2P22307 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCP2P22307 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCP2P22307 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCP2P22307 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCP2P22307 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCP2P22307 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCP2P22307 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCP2P22307 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCP2P22307 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCP2P22307 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCP2P22307 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCP2P22307 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCP2P22307 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCP2P22307 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCP2P22307 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCP2P22307 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCP2P22307 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCP2P22307 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCP2P22307 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCP2P22307 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCP2P22307 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCP2P22307 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCP2P22307 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCP2P22307 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCP2P22307 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCP2P22307 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCP2P22307 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCP2P22307 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCP2P22307 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCP2P22307 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCP2P22307 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCP2P22307 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCP2P22307 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCP2P22307 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCP2P22307 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCP2P22307 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCP2P22307 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCP2P22307 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCP2P22307 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCP2P22307 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCP2P22307 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCP2P22307 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCP2P22307 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCP2P22307 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCP2P22307 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCP2P22307 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCP2P22307 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCP2P22307 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCP2P22307 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCP2P22307 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCP2P22307 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCP2P22307 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCP2P22307 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCP2P22307 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCP2P22307 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCP2P22307 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCP2P22307 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCP2P22307 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCP2P22307 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCP2P22307 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCP2P22307 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCP2P22307 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCP2P22307 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCP2P22307 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCP2P22307 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCP2P22307 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCP2P22307 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCP2P22307 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCP2P22307 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCP2P22307 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCP2P22307 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCP2P22307 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCP2P22307 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCP2P22307 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCP2P22307 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCP2P22307 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCP2P22307 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCP2P22307 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCP2P22307 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCP2P22307 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCP2P22307 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCP2P22307 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCP2P22307 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCP2P22307 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCP2P22307 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCP2P22307 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCP2P22307 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCP2P22307 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCP2P22307 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCP2P22307 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCP2P22307 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCP2P22307 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCP2P22307 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCP2P22307 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCP2P22307 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms