Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BPBP20851 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BPBP20851 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BPBP20851 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BPBP20851 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BPBP20851 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BPBP20851 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BPBP20851 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BPBP20851 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BPBP20851 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms