Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF2RAP15509 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms