Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH1P12830 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH1P12830 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH1P12830 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH1P12830 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH1P12830 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH1P12830 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH1P12830 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH1P12830 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH1P12830 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH1P12830 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH1P12830 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH1P12830 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH1P12830 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH1P12830 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH1P12830 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH1P12830 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH1P12830 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH1P12830 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH1P12830 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH1P12830 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH1P12830 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH1P12830 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH1P12830 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH1P12830 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH1P12830 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH1P12830 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH1P12830 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH1P12830 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH1P12830 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH1P12830 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH1P12830 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH1P12830 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH1P12830 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH1P12830 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH1P12830 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH1P12830 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH1P12830 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH1P12830 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH1P12830 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH1P12830 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH1P12830 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH1P12830 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH1P12830 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH1P12830 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH1P12830 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH1P12830 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH1P12830 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH1P12830 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH1P12830 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH1P12830 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH1P12830 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH1P12830 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH1P12830 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH1P12830 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH1P12830 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH1P12830 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH1P12830 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH1P12830 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH1P12830 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH1P12830 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH1P12830 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH1P12830 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH1P12830 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH1P12830 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH1P12830 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDH1P12830 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDH1P12830 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH1P12830 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH1P12830 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH1P12830 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH1P12830 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH1P12830 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH1P12830 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH1P12830 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH1P12830 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH1P12830 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH1P12830 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH1P12830 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH1P12830 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH1P12830 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH1P12830 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH1P12830 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH1P12830 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH1P12830 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH1P12830 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH1P12830 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH1P12830 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH1P12830 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH1P12830 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH1P12830 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH1P12830 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH1P12830 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH1P12830 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH1P12830 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH1P12830 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH1P12830 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH1P12830 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH1P12830 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH1P12830 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms